照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。
关智一 雪野五月 野上尤加奈 三木真一郎 根谷美智子 大塚明夫 西村知道 田中正彦 广田行生 松本大 小川隆市 金子由之 岩松廉 山口由里子 杉田智和 石波义人 福山润 松本和香子 臼井孝康 山岸功 宗矢树赖 村井每早 室园丈裕 木村郁绘 能登麻美子 吉田小百合 栗田圭
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